На основании решения Ученого Совета медицинского факультета ОшГУ (протокол №7, 31.05.2002), утвержденного Большим Ученым Советом ОшГУ с разрешения Министерства образования, науки и культуры Кыргызской Республики и приказом ректора ОшГУ (01.07.2002г.) был открыт учебно-медицинский центр при медицинском факультете. 29 декабря 2003 года решением Ученого Совета ОшГУ учебно-медицинский центр был переименован в медицинское училище при Ош ГУ.       Медицинское училище располагалось на первом этаже факультета ЕГФ, им руководил старший преподаватель Уметалиев Мырзаалы Төрөбаевич. В августе 2003 года переведено в общежитие №5 ОшГУ.       С 2003 по 2012 учебные годы медицинским колледжом руководил к.м.н., доцент Беркмаматов Шамирбек Токтосунович, при котором подразделение обрело свой учебный корпус, был открыт морфологический корпус. В порядок приведен внешний вид учебного корпуса. Начался прием студентов в колледж на базе 9 класса. Были открыты специальности по учебному фармацевтическому и стоматологическому направлению. Студенты обспечены общежитием. В распоряжении студентов работала библиотека с 16 тыс. книг и читальным залом.

      - Каждый преподаватель имеет свой кабинет, которые оснащены отопительной системой.
В колледже открылись кабинеты, близкие к клинической модели: реанимационный, операционный, приемный процедурный, первая помощь для ребенка, лаборатории зубного врача и кабинет физиотерапии
      - Кабинеты оснащены необходимыми инструментами и тренажерами.
- В корпусе открылись компьютерные классы с интернет подключением.                   С 15 февраля 2012 года медицинским колледжом руководит кандидат биологических наук, доцент Аттокуров Курсантбек Шарабидинович
В настоящее время каждая кафедра оснащена необходимой орг. техникой. Обращается особое внимание воспитательной работе и творческим интересам студентов.
      Учебное заведение зарегистрировано в Министерстве образования, науки и культуры 10.10.2003г. под номером №923/1 и проводит свою деятельность на основании закона «Об образовании Кыргызской Республики» и своего устава. По законодательству Кыргызской Республики медицинский колледж является юридическим лицом. Учебное заведение находится в ведении ОшГУ, который выполняет функцию учредителя.

      На основании приказов Министерства образования и науки Кыргызской Республики №487/1 от 7 августа 2008 года «О переименовании средне-профессиональных образовательных учреждений» и ректора ОшГУ №913 от 31 октября 2008 года медицинское училище при ОшГУ было переименовано в медицинский колледж.
      В 2002 году по трем специальностям был произведен набор 92 студентов, в данное время в колледже получают образование около 3000 студентов.
      В медицинском колледже работают 195 преподавателей, среди них 17 кандидата наук, 7 доцента, 38 старших преподавателей, 126 преподавателей
      Колледж был признан победителем на меж. факультетском конкурсе “Окутуучулар обон созгондо”, посвященном 60-летию ОшГУ
      Колледж имеет 159 аудитории, 30 лабораторий, в клиническом корпусе находится 10 инновационных кабинетов, 370 - местная столовая.
В медицинском колледжде ОшГУ на базе 11-класса осуществляется подготовка по специальностям: 060101 «Лечебное дело» квалификация «Фельдшер»; 060102 «Акушерское дело» квалификация «Акушер»; 060105 «Стоматология» квалификация «Зубной врач»; 060106 «Ортопедическая стоматология» квалификация «Зубной техник»; 060108 «Фармация» квалификация «фармацевт»; 060109 «Сестринское дело» квалификация «Медицинская сестра», 060110 «Лабораторная диагностика» квалификация «Медицинский лабораторный техник»